Так изначально должно быть Приложение к договору с монтажными узлами. Заказчик подписал этот договор, исполнитель произвел работы согласно этого Приложения к договору. На крайний случай, в договоре должна быть ссылка на исполнительные схемы, в которые можно включить фактически исполненные узлы примыканий (с изменениями).
Или заключить доп.соглашение к договору на подготовку исполнительной док-ции, в ней покажете что получилось по факту.
Вот вроде бы получается и вопрос снят.