В контроллерах есть внутренняя память. Чаще всего её достаточно для программ. Но для увеличения используют флешкарты.
Но есть контроллеры, которые работают только с этими картами, так как не имеют внутренней памяти.
Поэтому ответ на данный вопрос даст мануал к контроллеру. В нем все расписано: что можно, что нельзя и что рекомендуется.
Поищите в сети по шильдику на контроллере.